A parte i compiti di assistenza per valutare la funzione polmonare, anticipare l’insufficienza dei muscoli respiratori e fornire la ventilazione meccanica, le attività di ricerca di Juana Martínez Llorens sono in linea con lo studio della funzione dei muscoli respiratori, essendo uno dei pochi centri a livello statale che esegue assiduamente esami invasivi e non invasivi per determinare e diagnosticare la disfunzione dei muscoli respiratori in pazienti neuromuscolari così come in altre malattie.